石墨坩堝在某些化學環境下簡單遭到腐蝕，如酸性物質。為了防止腐蝕，可在坩堝外表涂覆防腐材料，如油漆、樹脂等。
在高溫熔煉過程中，金屬熔液會對石墨坩堝內壁造成磨損。為了提高坩堝的耐磨性，可在內壁涂覆耐磨材料，如耐火磚、剛玉等。

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